Bağışıklık sistemi nasıl çalışır sorusunu sormak, aslında vücudun en organize savunma sistemini anlamak demek. Ve bu sistem düşündüğümüzden çok daha akıllıca tasarlanmış. Bağışıklık sisteminin iki ana katmanı var: doğal bağışıklık ve kazanılmış bağışıklık. **Doğal bağışıklık** (innate immunity) doğuştan gelen, hızlı tepki veren ilk savunma hattı. Bir yabancı madde ya da bakteri vücuda girdiğinde, bu sistem saniyeler-dakikalar içinde devreye girer. Cilt fiziksel bir bariyer, mide asidi kimyasal bir bariyer. Bunları aşan mikroplarla karşılaşan makrofajlar ve nötrofiller "düşmanı yut" komutuyla hareket eder. Ama bu sistemin hafızası yok, her seferinde aynı şekilde tepki verir. **Kazanılmış bağışıklık** (adaptive immunity) çok daha sofistike. T hücreleri ve B hücreleri bu sistemin ana aktörleri. Bir patojenle ilk kez karşılaştığınızda bu sistem onu tanımayı öğrenir. Günler sürer. Ama bir sonraki karşılaşmada hafızası devreye girer ve çok daha hızlı, çok daha spesifik bir yanıt üretir. Bağışıklık sistemi nasıl çalışır konusunda aşılar bu mekanizmayı kullanır. Hastalıklı etmenden zararsız bir parça ya da zayıflatılmış versiyonu verildiğinde, bağışıklık sistemi onu tanımayı öğrenir. Gerçek patojenle karşılaşıldığında hazırdır. Antikorlar da bu sistemin önemli bir parçası. B hücreleri tarafından üretilen antikorlar, spesifik patojenleri tanıyan proteinlerdir. Patojene bağlanarak onu ya etkisiz hale getirir ya da diğer bağışıklık hücrelerine işaret eder. Bağışıklık sistemi çok fazla ya da az çalışırsa sorun çıkar. Alerjiler, aşırı bir bağışıklık tepkisi. Otoimmün hastalıklar ise sistemin kendi dokularına saldırması. Denge her iki yönde de korunmalı.