Fungal hastalık epidemi modelleme, tarımsal patokimyasal yönetimin temelinde yatan karar destek sistemlerinin biyolojik çekirdeğidir. Monilinia (monilya) ve Botrytis cinerea bu modelleme çalışmalarının en çok araştırılan iki patojenidir; çünkü her ikisi de yüksek ekonomik kayıplara yol açan polifag türlerdir ve epidemi dinamikleri mikroklima değişkenlerine son derece duyarlıdır.\n\nFungal hastalık epidemi modelleme için sporulasyon koşullarının nicelleştirilmesi, hastalık yönetim kararını reaktif korumadan proaktif tahmine taşır. Botrytis cinerea konidyoforu için minimum sporulasyon şartları yaklaşık %93 bağıl nem ve 0-30°C sıcaklık aralığıdır; optimum sporulasyon 18-20°C'de, yüksek nem altında gerçekleşir. Serbest su varlığı, yağış ya da yoğunlaşma, spor çimlenmesi için zorunludur ve enfeksiyon periyodu genellikle 10-15 saatlik sürekli ıslaklıkla başlar.\n\nMonilinia epidemi modelleme açısından çiçek dönemindeki enfeksiyon kritik penceresidir. Sporlar rüzgar ve böcekler aracılığıyla stigmaya ulaşır; yüksek nem ve düşük-orta sıcaklık kombinasyonu geniş enfeksiyon havzaları yaratır. Günümüzdeki hastalık tahmin modellerinde hava istasyonu verisi entegre edilerek \"birikmeli ıslaklık saati\" eşiği hesaplanır ve bu eşik aşıldığında koruyucu fungisit uygulaması önerilir.\n\nFungal hastalık epidemi modelleme için kullanılan temel matematiksel çerçeve genellikle lojistik büyüme denklemi üzerine kurulu SEIR (Susceptible-Exposed-Infected-Removed) adaptasyonlarıdır. Sporulasyon oranı dış değişken olarak modele dahil edilirken konak popülasyonu başlangıç hassasiyeti, inokulüm yoğunluğu ve mikroklimatik bariyerler (rüzgar yönü, kanopi yapısı) modeli özelleştiren parametrelerdir.\n\nAlan uygulamasında hastalık eşiklerinin belirlenmesi, ekonomik zarar eşiği kavramıyla birleştirilir. Epidemi modelleme çıktısı fungisit uygulamasının gerekmediği, koruyucu uygulamanın yeterli olduğu veya tedavi edici protokolün zorunlu olduğu dönemleri ayırt etmeye yaramalı; bölgesel iklim değişkenliği modele dönemsel kalibrasyon güncellemeleri yoluyla yansıtılmalıdır.