Genom düzenlemede en sık kıyaslanan iki yöntem CRISPR-Cas9 ve TALENs. Her ikisi de hedefe yönelik DNA kesimi sağlıyor ama tasarım, maliyet ve hassasiyet açısından farklılaşıyorlar. Tasarım kolaylığı: CRISPR'da hedefleme bir rehber RNA dizisi ile sağlanıyor, 20 nükleotidlik dizi yeterli ve protein sabit. TALENs her hedef için yeni protein dizisi tasarlanmasını gerektiriyor, klonlama ve doğrulama uzun mesai. Hızlı prototipleme için CRISPR açık ara önde. Hedef dışı etki: TALENs'in hedef dışı kesim oranı bazı değerlendirmelerde CRISPR'a göre daha düşük raporlanıyor, çünkü TALEN proteininin tanıma bölgesi daha uzun ve baz uyumsuzluğuna daha az toleranslı. CRISPR'da yüksek doğruluklu Cas9 varyantları ve nikaz çift kesim stratejileri bu açığı kapatmaya çalışıyor. Kesim mekanizması: CRISPR-Cas9 künt uç, TALENs yapışkan uç kesim üretiyor. Yapışkan uçlar bazı tamir reaksiyonlarında daha kontrol edilebilir sonuç veriyor. Erişim: TALENs proteinleri büyük, viral vektörlere sığdırmak zor. TALENs mitokondriyel DNA gibi rehber RNA ile hedeflenmesi zor bölgelerde hâlâ değerli. Maliyet: CRISPR rehber tasarımı saatler içinde biter, sentez ucuz. TALENs için süreç haftalar alır, maliyet birkaç kat yüksek. Sonuç: Hız ve maliyet öncelikse CRISPR, hedef dışı profil kritikse veya CRISPR ile hedeflenemeyen bölge varsa TALENs makul. Sizin laboratuvarınızda hangisi daha sık kullanılıyor?